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汽车注册登记联丢失，可以按照以下步骤进行处理。
1、车主携带所需资料，到当地车管所申请补领机动车登记证书，需要提交的资料包括：机动车牌证申请表、机动车所有人的身份证明原件和复印件、机动车查验记录表（当场办理），如果机动车所有人为单位，建议携带营业执照原件和复印件，如果是代理行为，还需提交授权委托书和代理人的身份证明原件和复印件，还需要提交车辆行驶证和丢失的注册登记联复印件等材料。
2、在车管所受理之后，会对车辆进行查验，查验完成后会给予回执单，车主拿着回执单和车辆的相关证件到车辆检测窗口进行排队检测车辆，检测合格后，车主会拿到机动车检验合格标志的申请表，然后车主将车辆开到办证大厅门口等待检验合格标志的制作，最后车主携带相关资料到办证大厅取号排队办理车辆登记证书手续即可。
流程仅供参考，建议直接联系当地车管所或交警部门咨询具体的办理流程和所需材料，以便快速准确地解决问题。